Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EAF2Q96CJ1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EAF2Q96CJ1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms