Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4CQ96CF2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms