Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDAQ92838 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EDAQ92838 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EDAQ92838 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDAQ92838 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
EDAQ92838 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDAQ92838 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDAQ92838 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EDAQ92838 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDAQ92838 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDAQ92838 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDAQ92838 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDAQ92838 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDAQ92838 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDAQ92838 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDAQ92838 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDAQ92838 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDAQ92838 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDAQ92838 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EDAQ92838 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms