Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRUQ92729 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRUQ92729 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms