Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RB1CC1Q8TDY2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RB1CC1Q8TDY2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms