Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CARMIL3Q8ND23 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms