Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LINC00612Q8N6U2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms