Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC155Q8N6L0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC155Q8N6L0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms