Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A9Q8IVB4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A9Q8IVB4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms