Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms