Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOA5Q6Q788 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA5Q6Q788 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms