Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms