Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ABLIM2Q6H8Q1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABLIM2Q6H8Q1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms