Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1DP3Q658K8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EEF1DP3Q658K8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms