Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF123Q5XPI4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms