Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USPL1Q5W0Q7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms