Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH4AQ5TD94 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH4AQ5TD94 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms