Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UVSSAQ2YD98 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UVSSAQ2YD98 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms