Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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SGCAQ16586 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SGCAQ16586 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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SGCAQ16586 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SGCAQ16586 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SGCAQ16586 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SGCAQ16586 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCAQ16586 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SGCAQ16586 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SGCAQ16586 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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SGCAQ16586 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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SGCAQ16586 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SGCAQ16586 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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