Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCN9AQ15858 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
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