Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNA2Q15822 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA2Q15822 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms