Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1CQ15572 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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