Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX1-1Q15270 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKX1-1Q15270 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
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