Protein–RNA interactions for Protein: Q14CW9

ATXN7L3, Ataxin-7-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3Q14CW9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATXN7L3Q14CW9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms