Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDCD11Q14690 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms