Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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