Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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MKRN4PQ13434 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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MKRN4PQ13434 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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