Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDE3BQ13370 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE3BQ13370 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
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