Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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SEMA3BQ13214 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3BQ13214 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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