Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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