Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNTN1Q12860 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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