Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
HMGXB3Q12766 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HMGXB3Q12766 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
HMGXB3Q12766 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
HMGXB3Q12766 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
HMGXB3Q12766 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
HMGXB3Q12766 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
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