Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG1Q06432 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms