Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3AQ05086 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE3AQ05086 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms