Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN7AQ01118 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms