Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLTCQ00610 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms