Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP1Q00587 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms