Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMO4P61968 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LMO4P61968 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LMO4P61968 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LMO4P61968 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms