Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms