Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL23P55773 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL23P55773 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL23P55773 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCL23P55773 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL23P55773 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL23P55773 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCL23P55773 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCL23P55773 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCL23P55773 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms