Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AFDNP55196 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AFDNP55196 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFDNP55196 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFDNP55196 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFDNP55196 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFDNP55196 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFDNP55196 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFDNP55196 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AFDNP55196 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFDNP55196 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFDNP55196 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AFDNP55196 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFDNP55196 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFDNP55196 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFDNP55196 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AFDNP55196 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AFDNP55196 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AFDNP55196 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AFDNP55196 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms