Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5CP51148 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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RAB5CP51148 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RAB5CP51148 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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RAB5CP51148 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RAB5CP51148 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RAB5CP51148 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RAB5CP51148 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RAB5CP51148 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RAB5CP51148 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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RAB5CP51148 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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