Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VEGFBP49765 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms