Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP5P45974 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP5P45974 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP5P45974 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP5P45974 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP5P45974 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
USP5P45974 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP5P45974 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP5P45974 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms