Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GRIA2P42262 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIA2P42262 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms