Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP8P40818 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP8P40818 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP8P40818 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP8P40818 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP8P40818 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP8P40818 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP8P40818 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP8P40818 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP8P40818 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP8P40818 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
USP8P40818 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP8P40818 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP8P40818 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP8P40818 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP8P40818 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms