Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CEACAM6P40199 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CEACAM6P40199 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms