Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXD13P35453 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD13P35453 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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