Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA10P31260 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA10P31260 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms