Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms